西南大学洁净能源与先进材料研究院和材料科学与工程学院于2013年12月19日合并成立西南大学材料与能源学部，下设重庆市洁净能源与先进材料研究院、材料科学系、材料工程系三个院系。

为建设国内一流、国际领先的材料与能源学科，搭建洁净能源与科学、纳米生物技术等交叉领域的知识创新中心、高新技术研发中心、高层次人才培养中心、国际合作交流中心，原西南大学洁净能源与先进材料研究院成立于2011年3月28日，美国医学与生物工程院院士、英国皇家化学学会会士、西南大学教授李长明博士受聘为研究院院长，以其带领的海外归国团队为基础，整合西南大学已有科研人员组建而成。原西南大学（原西南师范大学）材料科学与工程学院，是为实现学校全面发展、走综合化发展道路、加强工科基础发展而于2003年成立的学院，由中国工程院院士曾苏民教授担任名誉院长。