南京信息工程大学坚持国际化办学理念，广泛开展国际交流与合作，具有一定的国际影响。

先后与美国的耶鲁大学、马里兰大学、乔治·梅森大学、德克萨斯大学、威斯康星大学、加拿大的多伦多大学、戴尔豪斯大学，澳大利亚的昆士兰大学、韩国的朝鲜大学、日本新潟大学等三十多所国外著名高校、学术研究机构建立了科学研究、人才培养的合作关系，互派访问学者和留学生，联合招收本科生及研究生。学校拥有“世界气象组织区域培训中心”，具有招收“中国政府奖学金”留学生资格。学校已为近百个国家培养高级管理及业务骨干600多名，高质量地承办了世界气象组织第十届气象教育与培训大会、“人类活动对亚洲季风的影响”国际学术研讨会等一批重要会议。