长久以来都是大陆清华大学优於 清华大学.具体可以参考以下两大排名.

2013年两岸四地(中台港澳)百强大学排名：

排名亚洲排名排名 21 1 国立 大学 29 2 国立交通大学 33 3 国立清华大学 36 4 国立成功大学 46 5医学大学 49 6 国立阳明大学 51 7 国立 科技大学 59 8 国立中央大学 73 9 国立中山大学 75 10 国立 师范大学 81 11 长庚大学 89 12 国立中兴大学 119 13 国立政治大学 123 14 国立 科技大学151~160 15 逢甲大学171~180 16 国立中正大学191~200 17 国立 海洋大学201~250 18 辅仁大学 201~250 18 元智大学251~300 20 中原大学251~300 国立彰化师范大学251~300 国立暨南国际大学251~300 国立东华大学251~300 国立 第一科技大学251~300 国立 大学251~300 国立云林科技大学251~300 东吴大学251~300 东海大学

中国院校排名8 北大14 清华22 复旦25 中国科大26 南京28 上海交大31 浙大42 北京师大50 南开54 中山57 西安交大63 武汉65 同济72 上海77 哈工大78 中国人大79 北京航空航天、北京理工84 东南85 厦门93 天津99 华东理工102 华中科大103 中国农业105 吉林106 山东108 华东师大109 北京交大111 川大118 北京工业125 大连理工133 北京科大136 兰州139 中南150 北京外语151-160 东华、国防科学技术161-170 西北工业、华南理工171-180 湖南181-190 北京化工、电子科大191-200 北京中医药、重庆、南京农业、上海师大、蘇州201-250 北京邮电、中国药科、哈工程、华中农业、南京航空航天、南京理工、东北师大、东北、中国海洋、陕西师大、上海外国语、上海财经、华南师大、云南251-300 中国地质、中国矿业、中国石油、福州、河海、华中师大、南京师大、华北电力、西北农林科技、对外经济贸易、西安电子科大、郑州

港校排名3 港大5 香港科大6 香港中大11 香港城市27 香港理工45 香港浸会128 岭南